RNA Mini Kit, 50 reaksjoner

1. Jens Keilwagen, Michael Wenk, Jessica L. Erickson, Martin H. Schattat, Jan Grau, Frank Hartung, Using intron position conservation for homology-based gene prediction, Nucleic Acids Research, Volume 44, Issue 9, 19 May 2016, Page e89, https://doi.org/10.1093/nar/gkw092

1. Nach der Extraktion keine RNA detektiert?

Falls Sie nach der Extraktion keine RNA detektieren können, kann es sein, dass die RNA zu gering konzentriert ist. Wir empfehlen Ihnen entweder die Menge des Ausgangsmaterials zu erhöhen oder die RNA nach der Extraktion zu fällen. Fällen Sie die RNA mit einer 30:1-Mischung aus absolutem Ethanol und 3M NaAcetat. Resuspendieren Sie die RNA, nach einem Waschschritt mit 70%-igem Ethanol, in 5-10 µl RNase freiem Wasser. Danach sollte Ihre RNA-Konzentration hoch genug sein um detektiert werden zu können.

2. Das RNA-Pellet haftet nicht an der Tube-Oberfläche?

Nach den Zentrifugationsschritten ist es wichtig das RNA-Pellet vollständig zu trocknen. Falls das RNA-Pellet fest an der Tube-Oberfläche haftet, können Sie das Tube invertiert auf ein Papiertuch stellen und einfach trocknen lassen. Manchmal haftet das RNA-Pellet aber nicht fest an der Tube-Oberfläche. Das ist ganz normal und hat keinen Einfluss auf die Qualität Ihrer RNA. Wir empfehlen Ihnen dann die Stelle Ihres RNA-Pellets von außen auf dem Tube zu markieren und erneut zu zentrifugieren (Wichtig: Drehen Sie das Tube so, dass das RNA-Pellet nach oben zeigt). Wir empfehlen Ihnen den Überstand mit der kleinsten Pipette abzunehmen. Zusätzlich können Sie das Pellet im Heizblock 15 min bei 37°C trocknen. 

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